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| Orden | Familia | Nombre Común | Nombre Inglés | Nombre Portugués | Nombre Científico | Registros | Probabilidad de observación | |
| 1 | Crocodilia | Alligatoridae | Spectacled Caiman | Caiman crocodilus | 2 | III | ||
| 2 | Squamata | Boidae | Corallus hortulanus | 1 | III | |||
| 3 | Anaconda Verde | Eunectes murinus | 1 | III | ||||
| 4 | Colubridae | Xenopholis scalaris | 1 | III | ||||
| 5 | Dactyloidae | Anolis gracilipes | 1 | III | ||||
| 6 | Iguanidae | Anolis aequatorialis | 1 | III | ||||
| 7 | Conolophus pallidus | 1 | III | |||||
| 8 | Basiliscus galeritus | 1 | III | |||||
| 9 | Iguana de Tierra de Galapagos | Galapagos Land Iguana | Conolophus subcristatus | 7 | V | |||
| 10 | Iguana Marina | Amblyrhynchus cristatus | 9 | VI | ||||
| 11 | Iguana Verde | Iguana iguana | 5 | IV | ||||
| 12 | Teiidae | Tegu Dorado | Tupinambis teguixin | 2 | III | |||
| 13 | Tropiduridae | Uracentron flaviceps | 1 | III | ||||
| 14 | Lagartija de Lava | Microlophus albemarlensis | 6 | V | ||||
| 15 | Testudines | Cheloniidae | Tortuga Verde | Green Turtle | Tartaruga Verde | Chelonia mydas | 2 | III |
| 16 | Podocnemididae | Tortuga Terecay | Podocnemis unifilis | 2 | III | |||
| 17 | Testudinidae | Geochelone nigrita | 1 | III | ||||
| 18 | Tortuga Gigante de Santa Cruz | Chelonoidis porteri | 6 | V |
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